三重四极质谱仪(TQMS，或QqQ)是一种串联质谱仪，由两个四极质谱仪组成，在它们之间有一个(非质量分辨)无线电频率的四极，作为碰撞细胞进行碰撞诱导解离(CID)，以碎片所选的前体/母离子，并产生碎片/子离子。
三重四极质谱计可在前驱离子扫描、中性损耗扫描、产物离子扫描和MRM/SRM四种扫描模式下工作。虽然在质量分辨率和质量范围上TQMS不是很突出，但三重四极杆具有便宜、高效和易于操作的优点。与此同时，质谱/质谱技术允许以串联的方式进行质量分析。TQMS不仅可以通过碎片模式来探索分子结构，而且在SRM模式下具有更好的检测灵敏度和定量性，特别是在小分子分析时。
TQMS在以下领域得到了广泛的应用:
食品与环境分析:添加剂，微量/污染物扫描，包括抗生素和农药
临床研究:临床前试验、内分泌及生物标志物
法医学和毒理学:杂质、药物分子结构鉴定和生物流体分析
药物发现与开发:先导化合物优化、ADME、PK/PD及药物代谢物测定
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