介绍
在生理条件下，蛋白质与蛋白质之间的相互作用大多是短暂的，而且发生的时间很短，因此很难进行研究。交联试剂，或交联剂，提供分析溶液来捕获蛋白质-蛋白质复合物，当它们相互作用时，通过共价将它们结合在一起，以冻结即使是短暂的，微弱的相互作用，以便随后的分离和表征。
交联条件
交联可在体内或体外进行。是否在体内或体外使用交联取决于项目的具体需要。在体内交联时，蛋白质以天然状态交联，而在体外交联时，蛋白质可能是变性的。
体内交联
在体内交联，蛋白质是在细胞内连接的，因此可以消除假阳性相互作用或失去蛋白质复合物稳定性的风险。疏水性和脂溶性交联试剂常用于与位于细胞膜内的蛋白质发生反应，而亲水性和水溶性交联试剂则用于交联位于细胞膜上的蛋白质，如等离子体锚定受体。虽然蛋白质仍处于天然状态，但由于细胞内蛋白质的复杂性，体内交联的优化也很复杂，仍有可能发生非特异性交联。使用间隔臂较短的交联试剂可以消除非特异性交联问题。
体外交联
在体外交联过程中，细胞均质和裂解。因此，该方法更适合于分析较为稳定的蛋白质-蛋白质相互作用。当细胞在特定的裂解缓冲液中裂解时，反应条件易于控制，如温度、pH值、离子强度等。由于没有细胞边界，许多类型的交联试剂都适合于这种应用。非特异性交联更易控制。
交联方法类型:
化学交联
交联试剂通过在两个或多个生物分子的特定氨基酸官能团之间形成化学键，将相互作用的蛋白质、结构域或肽共价连接在一起。有许多商业的化学交联剂可以选择，同双功能或异双功能，长臂和短臂，可裂解和不可裂解，水溶性和-不溶性，根据项目的具体要求。同双功能分子针对蛋白质上的同一基团，而异双功能交联剂针对不同的蛋白质上的不同基团，具有更大的变异性或特异性。交联剂分子也可以设计成包含可劈开的元素，如酯或二硫键(见下图)，分别通过添加羟胺或还原剂来逆转或破坏键。交联剂可以是疏水的，允许通过进入疏水蛋白域或通过细胞膜或亲水性限制交联到水室。
Photoreactive交联
作为添加交联剂交联细胞悬浮液或细胞溶解产物可能会导致许多不具体的形成,除了目标蛋白质交互,创建更复杂的交联剂的设计包含photoreactive组,在选择反应时间和只有在应对由紫外线照射。具有化学交联基团和光反应基团的异型双功能交联剂可以通过两步反应选择性地与目标蛋白反应。
交联蛋白相互作用分析的特点
交联蛋白相互作用分析流程
排序过程：
