代谢组学可以检测到哪些样本?
答:代谢组学主要研究小分子代谢物(MW<1000)作为各种代谢途径的底物和产物。可检测的样品主要是尿液、血浆或血清、唾液、细胞和组织提取物。我们还做过植物、真菌、微生物提取、脑脊液、淋巴液、昆虫血淋巴、羊水、卵泡液、膝关节滑膜液、眼泪、精液、粪便和肠道内容物提取等。
我需要为代谢组学建立生物复制吗?应该建立多少个生物复制?
答:与基因和蛋白质相比，代谢物处于生命活动的下游，具有较高的动态波动。因此，为了减少个体差异，有必要建立多次生物重复，以增加数据的可靠性和说服力。
例如，植物和微生物可重复6-8次，动物可重复10次或更多次。然而，临床要求要高得多，因为人类的个体差异非常大，通常建议进行30个或更多的生物重复。
代谢组学能检测到的代谢物的最低水平是多少?
答:不同的检测平台有不同的灵敏度。LC-MS的灵敏度最高，可达到fM级。对于相同含量的不同物质，质谱的电离效率和信号响应强度因其自身的化学性质而有很大差异。一种物质的检测灵敏度与其自身的化学性质有关。化学性质的影响主要表现在电离效率和质谱碎片行为。因此，相同含量的不同物质可能被一种检测到，而不是另一种。
如果两组最终采集的样本数不一样，这样比较两组是否可以?
是的。更重要的是，每组的生物重复数量都足够高，而不是两组的比较分析。
同一批非靶向代谢组学样本能否在较长时间内分批测试?
A:是的，但是不建议超过两周的批次。这是因为仪器的响应会随着时间的变化而有所不同，并且在不同的时间测试相同数量的物质的峰值面积是不同的。非靶向代谢组学分析计算基于峰值面积的含量变化乘法。两个或多个批次的检测会导致计算结果出现较大误差。
