蛋白质从头测序的样本类型是什么?
答:蛋白质从头测序与蛋白质的大小和长度无关。单克隆抗体、Fab/Fc抗体、双抗体、多抗体、重组蛋白、多肽、荧光标记抗体、交联抗体等可用于从头测序。
荧光标记或交联抗体可以用于从头测序吗?
答:与珠粒交联的蛋白质或荧光标记的蛋白质，如流动抗体FITC、Cyc5、PE和其他标记抗体，也能够进行从头测序。
对于未知蛋白质，如果蛋白质的n端有环闭合或者在n端有未知修饰，如何准确地分析蛋白质序列?
答:对于序列未知的蛋白质，特别是修饰重组蛋白、体外合成蛋白、修饰抗体或基因序列未被研究的蛋白质，这类蛋白质的信息往往不包含在蛋白质数据库中。这种蛋白质序列的准确分析必须通过蛋白质的从头测序来实现。
发送蛋白质从头测序样品的要求是什么?
答:标准样品量100ug，纯度90%以上。蛋白质纯度对测序结果有很大影响。杂质抗体蛋白、同源蛋白、BSA干扰样品测序，影响实验结果。
样品缓冲液的组成对测序结果有影响吗?
答:蛋白水解缓冲液的标准样品递送建议是使用PBS或Tris缓冲液系统。如果有甘油、牛血清白蛋白、除鳞剂、盐等，我们会做相应的纯化处理，所以不会影响测序结果。
样本糖基化和翻译后修饰会影响测序吗?
回答:没有。在数据分析过程中考虑到可能的翻译后和糖基化修饰，但不影响样本本身的测序结果。
蛋白质从头测序结果的准确性如何?
答:测序结果确保全序列覆盖和100%的序列准确性。每个位点上的每个氨基酸都由十多种不同的多肽支持。每个氨基酸在质谱中都有很强的断裂峰。测序结果与软件算法和人工检查相结合，以确保测序的准确性。
