外来体蛋白质组学是一个迅速发展的领域，有可能彻底改变我们诊断和治疗疾病的方式。外泌体蛋白质组学的一个令人兴奋的应用是在寻找疾病发展的新标志物。已知外泌体含有多种生物分子，包括蛋白质、核酸和脂质，可以使用质谱和其他蛋白质组学技术进行分析。通过分析外泌体的蛋白质含量，研究人员可以识别出癌症、神经退行性疾病和传染病等疾病的新的生物标志物。这些生物标记物可以用于早期检测、监测疾病进展和开发新的治疗方法。外泌体蛋白质组学的研究有可能极大地促进我们对疾病发展的理解，并改善患者的预后。
阿尔茨海默病潜在的非侵入性早期生物标志物的鉴定(1）
阿尔茨海默病(AD)是一种常见的老年性疾病，是一种不可治愈的神经退行性疾病。患者大脑中会出现淀粉样斑块沉积，这些沉积会破坏脑神经组织的结构和功能，导致神经元细胞死亡和认知功能丧失。通过在β-淀粉样斑块沉积发生之前识别候选生物标志物，阿尔茨海默病对于AD的早期干预非常重要。
研究人员收集了5XFAD小鼠和同一窝对照组小鼠的尿液样本，并分离和提取了外泌体。通过NTA粒度浓度分析进行外泌体鉴定，通过WB验证外泌体标记物的表达。随后，通过LC-MS/MS对外泌体蛋白进行定性和定量分析。5XFAD组和对照组在88种尿外泌体蛋白上发现了显著差异。与对照组相比，53个蛋白表达上调，27个蛋白表达下调。随后，经过聚类和GO分析，6个蛋白被鉴定为AD生物标志物，具有很高的潜力作为AD候选尿外泌体生物标志物。然后通过WB、ELISA和MRM靶向蛋白分析对差异蛋白进行验证。
验证结果表明，一些尿液外泌体蛋白，特别是膜联蛋白2和Clusterin，能够在淀粉样蛋白斑块沉积之前检测到差异，这可能是预防AD的非侵入性生物标志物的理想来源。
5XFAD转基因AD小鼠模型尿外泌体的分离、鉴定和蛋白质组学研究
紫杉醇和阿霉素利用肿瘤在化疗期间释放的外泌体改变肺微环境（2）
为了测量肿瘤源性ev是否参与ptx诱导的乳腺肿瘤转移，对ptx处理的肿瘤进行体外培养，提取肿瘤培养上清外泌体，发现紫杉醇处理的癌细胞产生的外泌体显著促进肿瘤细胞在肺中的定殖。研究人员假设，化疗诱导的外泌体促肿瘤转移能力的增强是由于它们携带的蛋白质。因此，通过液相色谱-质谱(LC-MS)对PTX和CREMO处理过的肿瘤细胞外泌体进行蛋白质组学分析，发现PTX处理过的肿瘤细胞外泌体富集了ANXA6蛋白。DOX处理后ev中ANXA6蛋白含量也可增加。随后，外泌体蛋白ANXA6通过基因敲除和表达证实其促进乳腺癌肺转移功能。此外，血液外泌体功能分子ANXA6在临床乳腺癌患者中得到验证。
PTX化疗后肿瘤外泌体蛋白质组学
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参考文献
- 宋志奇，等。“在5XFAD小鼠模型中泌尿外泌体的综合蛋白质组学分析和阿尔茨海默病潜在的非侵入性早期生物标志物的鉴定。”遗传学前沿11(2020):565479。
- Keklikoglou, Ioanna，等。“化疗在乳腺癌模型中引发了促转移性细胞外囊泡。”自然细胞生物学21.2(2019):190-202。