用于2D PAGE的酵母样品可以在(1)初始细胞破坏步骤中制备;(2)蛋白质溶解步骤;(3)核酸酶处理步骤;(4)最后阶段,在应用于2D PAGE的第一维之前,将蛋白质提取物在IPG补液缓冲液中稀释。
该过程在1.5 ml微离心管中进行。合适的起始材料是从10ml培养基中提取酵母细胞小球,密度为5-10百万细胞/mL,对应于光密度(610 nm)约为0.5,通常会产生5-10 μL细胞的小球。将下面描述的方法调整为此数量的单元格。
协议可以扩大或缩小;但是,应注意不要使用超过500 μL或小于50 μL的最终萃取量,因为这将降低细胞破坏步骤的效率。
1.细胞的破坏
A.向细胞颗粒中加入160 μL含有蛋白酶抑制剂的冰水。
B.在样品中加入0.25 g冷却后的玻璃珠(直径0.5 mm)。
C.在台式振动筛上以最高转速(约2500转/分)涡流4 × 30秒,间歇将样品放置在冰上至少1分钟。
2.蛋白溶解
A.加入20 μL的样品缓冲液I,使试管短暂旋转混合。
B.将试管置于95°C下5分钟。确保将试管盖固定,或将试管置于
C.在加热步骤之前,在盖子上打一个小洞。
D.在冰上冷却样品5分钟。
3.核酸酶治疗
A.加入20 μL的样品缓冲液II,使试管短暂旋转混合。
B.冰上孵育10分钟。
C.在4°C的微离心机中全速(约15,000g)离心样品。
D.将上清液(构成蛋白提取物)吸清至新的微离心管中,在-20°C冷冻,或立即使用。
4.ipg -补液缓冲液稀释
A.将样品溶解在所需体积的ipg -再水化缓冲液中。
B.将样品在37℃下孵育10分钟。
C.旋转样品(15000 g,室温,10分钟),去除任何可能残留的颗粒。
参考
- J. M.沃克(主编)。(2005)。蛋白质组学协议手册。胡玛纳出版社。