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用iTRAQ蛋白质组学揭示骨关节炎和脑科学的新见解在线调查

iTRAQ(等压相对和绝对定量标签)蛋白质组学是一种强大的技术,可以同时识别和定量成千上万的蛋白质。它已被证明在研究复杂疾病如骨关节炎和脑相关疾病方面特别有用。在骨关节炎研究中,iTRAQ蛋白质组学已被用于识别潜在的生物标志物,用于早期诊断和疾病进展监测。同样,在脑科学研究中,iTRAQ蛋白质组学已被用于研究阿尔茨海默病和帕金森病等神经退行性疾病的分子机制。通过分析这些疾病患者样本的蛋白质含量,研究人员可以对疾病病理有新的认识,并确定潜在的治疗靶点。总的来说,iTRAQ蛋白质组学有可能大大提高我们对复杂疾病的理解,并改善患者的结果。

案例1:在分子水平上找到摧毁骨关节炎的武器(1)

骨关节炎(OA)是一种年龄相关或创伤后退行性关节疾病,其特征为关节软骨丧失、软骨细胞肥厚分化、软骨下骨重塑、滑膜炎症和骨冗余形成。

在本研究中,我们利用iTRAQ蛋白质组学技术,分析了年轻和老年小鼠的软骨组织样本,共鉴定出5015个蛋白质,证明Fyn在人类OA软骨、老年小鼠软骨和创伤后OA软骨中的表达显著上调。随后的免疫沉淀和蛋白质组学联合分析表明,Fyn积聚在关节软骨细胞中,直接与β-catenin相互作用并磷酸化,从而稳定β-catenin并促进其核易位。Fyn抑制剂AZd0530和pp1通过阻断β-catenin通路和降低关节软骨细胞外基质分解代谢酶水平显著减弱OA进展。

该研究首先通过蛋白质组学确定了感兴趣的蛋白质。然后对该蛋白可能的功能进行了一系列验证。最后,我们证明了SFK家族成员Fyn在软骨退变和骨性关节炎发展中的重要作用,并为骨性关节炎提供了一个潜在的新治疗靶点。此外,本研究展示了组织学在大规模数据筛选方面的优势,为精准医疗研究提供有力支持。

Fyn积聚在老年小鼠和骨关节炎(OA)患者的关节软骨中。

Fyn积聚在老年小鼠和骨关节炎(OA)患者的关节软骨中。

研究目标温度管理在外伤性脑损伤中的调控及相关机制(2)

本研究旨在通过定量蛋白质组学技术探讨靶温管理(TTM)对创伤性脑损伤(TBI)的调控及其相关机制。使用细胞损伤控制器(SH-SY5Y和HT-2CIC)2细胞进行中度拉伸损伤,然后在TTM(低温,32°C)或常温(37°C)下孵育。实时形态变化,细胞周期相位分布,细胞死亡和细胞活性评估。受控皮质撞击器(CCI)产生中度TBI,并在体内测量TTM对神经损伤、神经退行性变、脑血管组织病理学和行为结局的影响。结果显示,TTM治疗可防止tbi诱导的脑神经元坏死,减少体外和体内神经元死亡,减少皮质损伤体积和神经元损失,减轻脑血管组织病理学损伤和脑水肿,改善行为结局。通过iTRAQ技术鉴定ttm调控的TBI相关蛋白。四种候选分子(纤维蛋白原[PLG]、抗凝血酶III [AT III]、纤维蛋白原γ链[FGG]和转运甲状腺素[TTR])在TBI大鼠脑组织和TBI人脑髓质中得到验证。本研究首次研究了TTM在TBI人类蛋白质组和TBI动物模型中的神经保护作用,提供了关于TBI脑蛋白质组的信息,并为进一步评估与TTM相关的候选分子奠定了基础。

使用iTRAQ方法对皮质挫伤影响(CCI)大鼠进行靶向温度管理的定量蛋白质组学比较。

使用iTRAQ方法对皮质挫伤影响(CCI)大鼠进行靶向温度管理的定量蛋白质组学比较。

参考文献

  1. 李,凯,等。“酪氨酸激酶Fyn通过激活β-连环蛋白途径促进骨关节炎。”风湿病年鉴77.6(2018):935-943。
  2. 程世祥,等。“基于itraq的定量蛋白质组学揭示了用靶向温度管理治疗创伤性脑损伤的新证据基础。”神经治疗学15(2018):216-232。
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