蛋白质组学蛋白质的大规模研究是支气管扩张研究的重要工具。支气管扩张剂是放松气道平滑肌的药物，从而使呼吸更容易。支气管扩张剂的有效性因人而异，蛋白质组学分析可以帮助确定这些差异背后的分子机制。通过研究对支气管扩张剂有不同反应的患者的支气管组织或细胞的蛋白质谱，研究人员可以确定新药或个性化治疗的潜在靶点。蛋白质组学还可用于监测对支气管扩张剂治疗反应的蛋白质表达变化，这可以为这些药物的作用机制提供见解。总的来说，蛋白质组学在促进我们对支气管扩张的理解和改善呼吸系统疾病的治疗方面具有巨大的潜力。
情况下（1）：
支气管扩张主要是一种中性粒细胞炎症性疾病，中性粒细胞胞外陷阱(NETs)的形成是一种宿主防御方法，与多种炎症性疾病有关。由于对导致严重疾病的潜在机制知之甚少，中性粒细胞炎症没有确定的治疗方法。
由英国邓迪大学James D Chalmers教授领导的一个跨国研究小组使用蛋白质组学来确定支气管扩张的严重程度和治疗反应的关键标志物。
研究内容包括:
1.使用液相色谱-质谱法鉴定英国邓迪市支气管扩张患者(n=40)与疾病严重程度相关的蛋白质组学生物标志物。共鉴定出799个蛋白，其中96个为差异表达蛋白，大部分与中性粒细胞炎症相关，包括RETN (ADSF)、S100-A9 (MRP-14)、S100-A8 (CFAG)、ELANE (HLE)、AZU1 (azurocidin)、MPO(髓过氧化物酶)、LCN2 (NGAL)。
2.来自英国TAYBRIDGE队列的175例患者和来自意大利、西班牙和美国的275例患者的人群队列进一步验证。支气管扩张症中与疾病严重程度相关的生物标志物NETs的鉴定NETs与疾病严重程度呈正相关，有严重恶化史的患者NETs显著升高，与患者生活质量评分QoL-B RSS呈负相关。
3.目的探讨致病菌是否影响严重支气管扩张患者NET浓度。研究了加重支气管扩张患者全身抗生素治疗14天后痰样本的蛋白质组学。分析显示，抗生素治疗与痰液中39种蛋白的表达改变相关(23种下调，16种上调)。通路分析显示，上调和下调的蛋白共享中性粒细胞脱粒和先天免疫系统过表达的相同途径。在与中性粒细胞脱粒相关的11种下调蛋白中，已知有10种是网络相关蛋白。
4.评估大环内酯治疗降低支气管扩张患者NET浓度的可能性和原因。分析显示，长期大环内酯类药物治疗抑制NET的形成，主要是在非嗜酸性疾病患者中。
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参考
- Keir, Holly R.等。中性粒细胞胞外陷阱、疾病严重程度和支气管扩张的抗生素反应:一项国际、观察性、多队列研究柳叶刀呼吸医学9.8(2021):873-884。